Irun es la segunda ciudad más grande de Gipuzkoa, después de San Sebastián, capital del territorio histórico. Linda al este con Hendaya, al norte con Hondarribia, al oeste con Oiartzun y al sur con Navarra a través de Bera. Con Hondarribia y Hendaya forma un consorcio transfronterizo que recibe el nombre de «Bidasoa-Txingudi».

Irun se distribuye oficialmente en siete barrios de carácter histórico: Anaka, Behobia, Bidasoa, Lapice-Lapitze, Meaka, Olaberria, Ventas de Irun y Santiago. Dispone de un skyline, que lo conforman los barrios del Este, como Artia, y la futurista Torre Zaisa, en Behobia. Es una de las urbes europeas, más lluviosas, comparándolas con otras de similar extensión a lo que hay que añadir que la Bahía del Bidasoa presenta la máxima precipitación media de toda la costa cantábrica.

Merecen un apunte especial las rocas triásicas del monte San Marcial, el más renombrado de Irun. En su cumbre se alza la ermita dedicada a este Santo, que recuerda las batallas ganadas a franceses y alemanes en junio de mil quinientos veintidós y mil ochocientos trece. En su término municipal se halla el parque natural de Plaiaundi y una parte del de Aiako Harria.